肛瘘患者在明确诊断后，应尽早地到有正规肛肠专科的医院接受手术治疗，不要认为肛瘘会自愈或不会给自身带来更多痛苦。
为什么肛瘘一定要尽早治疗？
一 、大多数肛瘘开始时都是低位单纯性的肛瘘，随着病情的反复发作，脓肿的反复形成，不但经常肿胀疼痛，有脓液排出，污染内裤，给生活带来不便，同时也会形成更多的支管，变成复杂性肛瘘，更值得重视的是还会向深部发展，形成高位肛瘘，给以后的手术带来困难。
二、由于肛瘘的反复发作，形成复杂性肛瘘及高位肛瘘，病变范围不断扩大和向上蔓延，不仅肛周的瘢痕范围扩大，影响肛周括约肌的功能，造成肛门功能的下降，而且手术时还可能损伤更多的肛门内、外括约肌，甚至肛管直肠环。这样的话，创面较大，患者痛苦亦较大，不但创面的愈合时间长，也可造成因肛门周围功能肌的损伤而导致肛门功能下降，形成不同程度的肛门失禁。
三、近年来，临床上时有报道肛瘘长期不愈而癌变，这可能是由于长期的慢性炎症刺激而致使癌变。如果肛瘘恶变后，行手术治疗一般很难保留肛门，而作腹部造瘘，给患者生活带来不便，在心理上造成负担。
四、由于肛瘘有反复肿痛溃脓的可能，特别是在身体疲乏时容易发生，脓水常污染内裤，肛门潮湿不适，进而可形成肛周湿疹等肛周皮肤病，增加患者的痛苦。
